由子宮內膜異位所引致的「朱古力瘤」,可導致不育,但如果只是草草透過藥物及手術解決朱古力瘤,未必可以解決問題,所以必須小心處理,例如切除朱古力瘤手術時,亦應除去盆腔內其他異位的內膜組織,確保子宮、輸卵管及卵巢等生育器官恢復正常狀態和聯繫,以助患者提高生育能力。手術後也不適宜接受藥物治療,因為藥物會抑制身體排卵,患者自然無法把握受孕的黃金機會。
此外,朱古力瘤的復發機會甚高,無論手術過程如何小心,每次手術都會破壞更多卵巢組織,所以最好還是及早懷孕。若手術後一年內仍無法懷孕,尤其是再次出現朱古力瘤,便應考慮採用生育科技治療法。
如果在懷孕過程中發現有朱古力瘤,需要定時監察胎兒及朱古力瘤的狀況,擔心朱古力瘤爆裂時,內裏的液體會刺激盆腔,引致炎症,甚至令子宮收縮,造成流產,所以必要時採取手術切除朱古力瘤以保障胎兒的性命。